Жизнь и творчество Мусы Джалиля находила отражение в музейных экспозициях неоднократно.

В 1983 году Постановлением правительства от 18.05.1982 года в Казани в доме № 17 по улице Горького, где в 1940–1941 годах жил Муса Джалиль с семьёй, был открыт Музей-квартира поэта (авторы экспозиции: Л. Г. Валеева, Л. Г. Жигалко, Д. Б. Багаутдинова, И. З. Мингазова). До 1987 года музей работал по графику, принимая посетителей три дня в неделю, с ноября 1987 года он работает ежедневно, кроме выходного дня.

20 марта 1991 года Исполнительным комитетом Казанского городского Совета принято решение «О расширении площадей помещения Музея-квартиры М. Джалиля» за счёт освобождения от жильцов квартиры № 27, площадью 56,5 кв. м, которая была освобождена только в ноябре 1995 года.

Капитальный ремонт музея был выполнен подрядчиком ОАО «Ютек» в соответствии с проектно-сметной документацией, и принят в эксплуатацию 19 февраля 1998 года. Общая площадь музея –130,8 кв. м.

После реконструкции появился литературно-музыкальный салон с экспозицией «Поэзия, любовь, война», которая работает с 2007 года (авторы: Г. Г. Нурутдинова, Г. Р. Сакаева, Н. Г. Фаттахова), выставочный зал (23,4 кв. м.), где работали выставки «Муса Джалиль в искусстве», «По следам войны», «Судьбой дарованные встречи» (авторы: Г. Р. Сакаева, Н. Г. Фаттахова). Сегодня в этом зале представлена интерактивная выставка «В гостях у Мусы» (авторы: Г. Р. Сакаева, Н. Г. Фаттахова) и мемориальные комнаты.

Согласно Постановлению Совета министров Татарской АССР от 18.05.1982 года Музей-квартира Мусы Джалиля был организован на правах отдела Государственного объединённого музея ТАССР. 23 марта 2001 г. Кабинет министров РТ принял Постановление о переименовании Государственного объединенного музея РТ в Национальный музей РТ.

С 1987 по 1989 год музеем заведовала И.З. Мингазова, с 1989 года – и. о. зав. Н.Г. Фаттахова, с 1991 по май 2008 г. – Г.Р. Сакаева, с июня 2008 года по январь 2024 г. — Н.Г. Фаттахова, с февраля по июнь 2024 г. — и. о. зав. Л.Ф.Харасова, с июля 2024 г. – А.И. Сафиуллина.

В 1993 году коллектив музея был награждён Почётной грамотой Министерства культуры РТ за плодотворную работу по пропаганде жизни и творчества поэта и в связи с 10-летием музея.

В 1998 году за доблестный труд и личный вклад в социально-экономическое и культурное развитие Вахитовского района коллектив награждён Почётной грамотой главы администрации Вахитовского района.

В 2003 году Музей-квартира Мусы Джалиля стал лауреатом премии «Лучший музей года».

В 2006 году Национальным комитетом общественных наград РФ музей награждён орденом Ломоносова за значительный вклад в патриотическое воспитание молодёжи и памяти воинов, павших в борьбе за свободу Отечества (орден № 180).

В 2008 году за многолетнюю плодотворную работу, высокий профессионализм, вклад в развитие музейного дела, пропаганду творчества и жизни великого татарского поэта-героя Мусы Джалиля и в связи с 25-летием со дня основания коллектив музея награждён Почётной грамотой НМ РТ.

В 2013 году туристическая компания «Тройка-плюс К» Музею-квартире Мусы Джалиля выразила благодарность за успехи в деле патриотического воспитания молодёжи, за профессионализм и творческий подход в развитии музея.